​Urodzony Youssef Antoun Makhluf 8 maja 1828 roku, jeden z pięciorga dzieci urodzonych Antoun Zaarour Makhloufa i Brigitta Chidiac. Mieszkali w miejscowości Bekaa Kafra , prawdopodobnie najwyższa w libańskich górach. Jego ojciec, kierowca mule, zmarł w sierpniu 1831 roku, wracając z pańszczyzny na tureckiej armii, pozostawiając żonę wdowę do opieki nad ich dziećmi. Później ożenił się ponownie człowieka, który udał się na poszukiwania do święcenia kapłańskiego i został proboszczem w wiosce.

Młody Youssef został podniesiony w pobożnym domu i szybko stał się uważnym w  życiu świętych i do pustelniczego życia, jak było praktykowane przez dwóch swoich wujków. Jako młody chłopak, był odpowiedzialny za opiekę dla rodziny w małym stadzie. Zabierał trzodę do groty w pobliżu, gdzie był zainstalowany ikonę z Najświętszej Maryi Panny . Spędzi dzień w modlitwie.